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《自然-細胞生物學》(Nature Cell Biology)于9月12日以長文(Article)形式在線發(fā)表中國科學院遺傳與發(fā)育生物學研究所楊崇林研究組與中國科學院昆明植物研究所郝小江研究組的合作研究論文PKC controls lysosome biogenesis independently of mTORC1。該論文揭示了細胞內溶酶體生成的重要信號傳導和調控機制。
溶酶體是細胞內物質降解和信號轉導的重要中心之一。溶酶體降解來源于細胞內、外的各種底物,如內吞膜蛋白及小分子物質、凋亡細胞、病原菌和自噬小體等。溶酶體的功能紊亂直接導致70多種溶酶體貯積病,且與神經退行性疾病密切相關??刂萍毎x的關鍵激酶mTOR定位于溶酶體上,通過感知細胞的營養(yǎng)狀態(tài)來調節(jié)細胞的生長和代謝。已有研究發(fā)現(xiàn),mTOR可以磷酸化溶酶體生成的轉錄因子TFEB和TFE3,抑制細胞內的溶酶體生成。當細胞處于饑餓狀態(tài)時,mTOR不能磷酸化TFEB/TFE3。未磷酸化的TFEB/TFE3因而進入細胞核中啟動溶酶體生成相關基因的轉錄,促進溶酶體的發(fā)生。但是,在正常營養(yǎng)供給狀態(tài)下,細胞如何應對內、外界信號而促進溶酶體的生成,是一個懸而未決的重要問題。
楊崇林研究組與郝小江研究組合作,以huo性天然小分子為探針,從化學生物學的角度探索溶酶體發(fā)生和穩(wěn)態(tài)平衡的調控機制。該研究首先建立溶酶體生成的篩選體系,經過大量篩選,從植物天然產物中發(fā)現(xiàn)了能在細胞正常營養(yǎng)狀態(tài)下促進溶酶體生成的、以HEP14和HEP15為代表的一類巨大戟烷型二萜類化合物(圖A)。該研究發(fā)現(xiàn),HEP14及其類似物通過不依賴于mTOR的方式選擇性地激huo轉錄因子TFEB,促進溶酶體生成。進一步研究發(fā)現(xiàn),該類化合物直接激huo蛋白激酶C(PKC)家族的成員PKCa和PKCd,導致蛋白激酶GSK3b的磷酸化,使之失huo。該研究表明,GSK3b可以直接磷酸化TFEB的134位和138位的絲氨酸,使TFEB處于非huo化狀態(tài),抑制溶酶體的生成。因此,PKC激huo引發(fā)的GSK3b失huo可以誘導TFEB入核而激huo,從而促進溶酶體的發(fā)生。另一方面,該研究還發(fā)現(xiàn)PKCd的激huo可以使溶酶體相關基因的抑制因子ZKSCAN3從細胞核中移位到細胞質中而失huo,從而解除其對溶酶體生成的抑制(圖B)。這一作用主要源于PKCd激huo導致的蛋白激酶JNK和p38的激huo,它們可以使ZKSCAN3的153位蘇氨酸發(fā)生磷酸化,引發(fā)ZKSCAN3的核-質移位。因此,PKC作為一個主控開關,控制兩條平行的信號通路,分別激huo溶酶體相關基因的轉錄因子TFEB和失huo轉錄抑制因子ZKSCAN3,從而促進溶酶體的發(fā)生(圖C)。
由于許多細胞外信號(如生長因子、激素、趨化因子、神經遞質、病原侵染等)可以與細胞膜上的受體(如RTK?GPCR和TLR等)結合,產生第二信使二酰甘油(DAG)而激huoPKC。因此PKC介導的溶酶體生成是細胞在響應外界信號時產生溶酶體適應(lysosomal adaptation)的一種重要調控機制。
該研究還發(fā)現(xiàn),在細胞模型中,激huoPKC的二萜類化合物HEP14通過依賴于溶酶體的方式促進脂滴和變性蛋白聚集體的清除。在阿爾茨海默疾病的APP/PS1小鼠模型中,腹腔注射HEP14可顯著減少小鼠腦部淀粉樣蛋白沉積斑塊的累積。研究表明這一效應依賴于PKC的激huo。這些結果提示PKC的激huo劑可能成為治療溶酶體貯積病及神經退行性疾病的潛在藥物。
楊崇林和郝小江為該論文的共同通訊作者。楊崇林研究組的博士后李洋和博士研究生徐猛為該論文的共同*作者;蹇友理、劉學釗和劉鍇參與細胞和生化實驗;郝小江研究組成員丁驍、晏晨、邸迎彤、唐貴華、穆淑珍等參與了干預溶酶體生成的huo性測試、化合物樣品的制備、光親和標記物的合成;遺傳發(fā)育所郭偉翔、汪迎春、黃夏禾和湯長勇在小鼠分析和蛋白質質譜分析方面提供了重要幫助;中科院生物物理研究所苗龍、陳聯(lián)萬和遺傳發(fā)育所楊崇林研究組的王鑫在免疫電鏡分析方面提供了重要幫助;遺傳發(fā)育所李婷在流式細胞術分析方面提供了重要幫助;HEP14等樣品zui早由貴州省-中科院天然產物化學重點實驗室郝小江研究組的宋智琴等提供。該研究受到國家自然科學基金委重點項目、科技部以及中科院項目資助。
(A) HEP14和HEP15促進溶酶體的生成。(B) HEP14誘導TFEB-EGFP從細胞質向細胞核轉移,同時mCherry-ZKSCAN3從細胞核向細胞質轉移。(C) 饑餓誘導的溶酶體發(fā)生機制(左)和PKC介導的溶酶體發(fā)生機制(右)的比較。