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中美倡議啟動(dòng)“地球生物基因組計(jì)劃”
  • 發(fā)布日期:2017-02-28      瀏覽次數(shù):1347
    •    在美國斯密森尼生物多樣性基因組學(xué)項(xiàng)目組與中國華大基因公司近日聯(lián)合主辦的生物基因組學(xué)會議(BioGenomics2017)閉幕論壇上,加州大學(xué)戴維斯分?;蚪M學(xué)家哈瑞斯·萊文等人和華大基因生物學(xué)家張國捷等組成的科研團(tuán)隊(duì)聯(lián)合倡議,科學(xué)家合作開啟另一項(xiàng)與人類基因組計(jì)劃(HGP)類似的項(xiàng)目——地球生物基因組計(jì)劃(EBP),對地球上所有真核生物進(jìn)行測序。

      據(jù)《科學(xué)》雜志報(bào)道,EBP計(jì)劃大約兩年前*次提出,將著重對包括所有植物、動(dòng)物和單細(xì)胞生物在內(nèi)的真核生物群體進(jìn)行測序。倡議團(tuán)隊(duì)估計(jì),得益于測序技術(shù)的進(jìn)步和成本下降,可能只需10年時(shí)間以及與HGP相當(dāng)?shù)馁M(fèi)用(約27億美元),就能完成對全部真核生物的測序。

      現(xiàn)有EBP框架大約分三步完成:*步,為9000個(gè)真核生物科中的每科選出一個(gè)代表進(jìn)行DNA測序,獲得的參考基因組要與人類基因組相當(dāng)或更好;第二步,對15萬到20萬個(gè)真核生物屬中每個(gè)屬選取一個(gè)物種測序,詳細(xì)程度不需達(dá)到*步的標(biāo)準(zhǔn);第三步,對150萬個(gè)真核生物物種進(jìn)行粗略性測序。

      項(xiàng)目倡議人員表示,EBP已經(jīng)取得良好開端,好幾個(gè)測序項(xiàng)目已經(jīng)啟動(dòng),包括為1萬種脊椎動(dòng)物進(jìn)行基因組測序的基因組10K項(xiàng)目、破譯5000種節(jié)肢動(dòng)物基因組的i5K項(xiàng)目、為1萬多種禽類物種測序基因組的B10K項(xiàng)目等。“我們就是要把EBP打造成‘戰(zhàn)斗機(jī)中的戰(zhàn)斗機(jī)’。”萊文說。

      在會議上,中國華大基因和英國韋爾科姆基金會桑格研究所等基因組學(xué)領(lǐng)頭企業(yè),表明了積極參與的立場,但EBP項(xiàng)目目前仍面臨重大挑戰(zhàn):一是因生物多樣性問題,只有更多發(fā)展中國家參與并開展更加化的合作,該項(xiàng)目才能zui終成型;二是制定高質(zhì)量測序和保存有機(jī)體樣本的標(biāo)準(zhǔn),其中因現(xiàn)有博物館動(dòng)植物樣品的保存方式不符合要求,或需要大量的野外采集樣品,這可能耗費(fèi)很大成本。

    魏經(jīng)理
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